1989/90 laufende Verschlechterung in Karabagh, Januar 1990 nationale Proteste in Baku, die von einer russischen Armee aus Moskau blutig niedergeschlagen werden. Mai 1990 Präsidentschaftswahlen, August 1990 Unabhängigkeit von Aserbaidschan, September 1990 Abspaltungserklärung der lokalen Behörden in Nagorni Karabagh.
Januar/Februar 1992 Niederlage der aserischen Armee gegen paramilitärische Kräfte aus Karabagh, die ihrerseits von der Republik Armenien unterstützt werden, Massaker in Khodzhaly, Mai 1992 Massaker in Latchin, Shusha, gewählter Präsident abgesetzt, Juni 1992 neuer Präsident gewählt, Austritt aus der GUS. März 1993 Khelbadzhar durch armenische Truppen eingenommen.
Juni 1993 Blutvergießen zwischen aserischen Truppen in Gandzha, Rebellion von Husseynov, zweiter Präsident flieht nach Nachitschevan. Aliyev wird als Präsident eingesetzt, er erzielt Kompromiß mit den Rebellen. Im Juli/August 1993 nehmen Armenier Agdan ein, die abtrünnige Republik Talyzh-Mughan wird ausgerufen und bricht zusammen.
Oktober/November 1993 wird Aliyev Staatsoberhaupt, Wiedereintritt in die GUS, armenische Truppen erobern das restliche Gebiet zwischen Nagorni Karabagh und dem Fluß Arax. Januar 1994 wird die Offensive der aserischen Armee zurückgeschlagen, das Waffenstillstandsabkommen bleibt wackelig. Im Mai 1994 wird ein erneutes Waffenstillstandsabkommen durch ausländische Vermittlung erreicht.
Im Oktober 1994 mißlingt ein Putsch der Sicherheitskräfte, Husseynov wird abgesetzt. Im März 1995 mißlingt ein erneuter Putschversuch, allgemeine Wahlen werden für den Oktober angekündigt. Aliyev gewinnt die Wahl und wird Präsident, er gewinnt erneut bei den Wahlen 1998.
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